Unter x86 und x64 versteht man die verschiedenen Windowsversionen bzw. genauer gesagt versteht man darunter die unterschiedlichen Prozessor-Architekturen.
So steht x86 für eine 32-Bit Windows Version, während x64 für eine 64-Bit Windows-Version steht.
Die verschiedenen Architekturen unterscheiden sich natürlich und bringen Vor- aber auch Nachteile mit sich. So lockt x64, als 64-Bit mit einer höheren Speicheradressierung, kann aber bei dem ein oder anderen Programm noch zu Komplikationen führen, wenn es lediglich für x86-Bit-Systeme programmiert wurde.
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Spätestens mit Windows 8 werde ich wohl auf 64 Bit setzen. Dafür noch die passende Multicore Hardware, dann passt alles.